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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

时不时为医药化工奶茶原料而被耳熟能详的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“新陈代谢废弃物”成为了“宝库小分子式”的辛酸史之路类似于,知道近三十年才被发觉其至关重要的生物体学实用功能,此后“平躺农奴把合唱”,非常是在免疫力支原体感染性症状理论研究业务领域内异彩纷呈。已建多页综述报道怎么写了在所有支原体感染性症状的食草动物整治中接受衣康酸或其药剂学绘制衍化物体的调理益处,连接数觉其因素靶点。有关于衣康酸的“前生”与“此生”,详情软文《乳酸的逆袭吧哥们——衣康酸!这课和你一起了解一下衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化绘制核蛋白组学产品,实现1000+玄妙度淡化位点查出,安全显现径典靶点,全方面生信剖析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“挖掘”到“印证”全步骤流程安全服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、實驗工艺流程

02、测试数据文件

03、经“点”初现

在实测值大数据中,排除很多个期刊论文中有关报道的径典靶点以至于衣康酸表达位点,如第一点个被知道的衣康酸共价表达血清KEAP1,也有糖酵解通道中的3个关键性性酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,及及炎性小体组建血清NLRP3和细胞系病变过程中 中的关键性性血清RIPK3等,其质谱图一下图如下。

04、好产品基本特征

1.强有力的加密管控质控

商家化特喜欢的人检查器孵育、SDS-PAGE检查、WB检验、子样本涉及到的性分析一下等双位置检查,确保安全生产大型项目没想到能信性。

2.高效能质谱分析仪器品台

在Orbitrap Astral全新几代高鉴别质谱仪作明佛母心咒下,达到衣康过酸装饰位点及淀粉酶技术鉴定新层次,注力学科的研究新遇到。

3.全程序流程一走式的服务

依托于拜谱生物制品建立完善的科学试验游戏平台,可出示“血细胞训练→测量器孵育→WB测量→玄妙度衣康碱化装饰测量→专属密码生信定性分析→某一位点PRM查验”全程序提供服务,省时省时省力更安心省心。

05、讲解网站内容(一些)

06、采用目标方向

PART 2、论文分享图片

专著一

日语主题词:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

汉语大标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

研究分析资源:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

论文参考文献二

英文翻译一级标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

中文字幕标题文字:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

深入分析内部:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、装修案例衍生物理念

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13包括较弱的底物紧密联系能力素质,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱微生物衣康过酸呈现组监测数据报告中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康碱化遮盖(如下所述图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱工作小结

作TCA间歇中的当中产生物,衣康酸缓解产生、免疫抗体检测力和慢性炎症病变当中的上下级功效,为根治免疫抗体检测力慢性炎症病变性疫情供应了改用根治攻略 。衣康酸结构的设计中的亲电性α,β-不饱和点羧酸结构的设计能对核高球蛋白上的灵活性半胱氨酸残基实行烷基化遮盖(迈克尔加上体现),相应翻译资料后遮盖被叫做“衣康酸遮盖(itaconation)”,从而危害核高球蛋白能力,调节免疫抗体检测力对答和产生途经,为多种不同疫情类药物研发团队供应新构思。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化掩盖蛋白质组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物分子生物学必然一定量靶向药物细胞代谢组(QMT1000)或能力基础新陈代谢靶向治疗基础新陈代谢组企业产品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

参考使用期刊论文

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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