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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 网路临床药理学呈现草酸钙肾结石空气氧化应激状态和宫颈炎症伤害措施

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿系统化里比较常见的的疾病之中。肾组织开展中CaOx尖晶石过供大于求火成岩会养成肾小管上皮细胞损害和凋亡,然而养成肾结石的养成。短链脂肪细胞含量酸由肠管内活性污泥法大肠杆菌发醇营养饮食纤维棉引起,不仅能在线条肠管深层中引领使用,但是在系统化水平方向上也引领至关重要使用。另外,丁酸是最丰富的的短链脂肪细胞含量酸,包括消除炎症和免疫力阻止使用,本科研试论丁酸对CaOx肾结石的使用极其内在靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山卫生院泌尿五官科吴忠客座教授、周子健教授于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教援、周子健医学博士在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱海洋生物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了网络上药学学的服务,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

文章标题名字:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 顾客基层单位:华山三甲医院 论述项目:大鼠、HK-2细胞膜 分成小组新信息:照表组(Con)、三维模型组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱展示技术水平:线上药学学测试

思维工作流程图模板

实验但是

分析考生先是在校园营销推广活动的环节之中所构建大鼠建模 ,确认生理特点血生化招生指标和组织机构病症学染料等分析方式看见丁酸能够避免CaOx建模 大鼠肾CaOx尖晶石的构成和影响,解决CaOx建模 大鼠的炎症病变影响和被阳极氧化成分的适度表达方法。另外,丁酸还可治理和改善草酸诱骗的HK-2神经细胞系影响、被阳极氧化应激性和神经细胞系凋亡。 为洞察具体分享一下一下丁酸设备构造特征和靶遗传什么是染色体网洛,研究方案员工从PubChem获得丁酸和丁酸酯的二维和立体设备构造特征(图1A)。使用PharmMapper大sql语句和Uniprot大sql语句解决后共挑选出1115个丁酸靶遗传什么是染色体供进一大步具体分享一下。将遗传什么是染色体全部导进STRING大sql语句,采取PPI网洛具体分享一下。Cytoscape给定了排顺的前20的核心区靶遗传什么是染色体的详情网洛图,有CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这一些核心区遗传什么是染色体与网洛中的别遗传什么是染色体均行为 出特定的涉及到性,原因分享这一些遗传什么是染色体应该充分激发着协同管理目的。GO和KEGG具体分享一下折射出了丁酸核心区遗传什么是染色体的涉及到方式和动物体学能力(图1C)。核心区遗传什么是染色体常见与类固醇性皮质激素对答、空气硫化应激化学反应性对答、活力氧细胞膜对类固醇性皮质激素激励的发应包括对含酸性化学元素元素的发应相关的英文。上述讲到所讲,这一些核心区遗传什么是染色体常见通过了空气硫化应激化学反应性和对活力氧的动物体发应的时候,是肾结石型成缘由中至关关键性的方式,这表达丁酸应该在肾结石中充分激发关键性目的。

图1| 丁酸构成与靶染色体网络信息分析一下(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一歩生命的进化丁酸对CaOx肾结石其实切靶遗传表观遗传遗传,的探索员巧用GEO数剧信息库对GSE73680中良好差表与CaOx肾结石女性的遗传表观遗传遗传差距参与了的探索。差表组与CaOx结石女性的偏态力差距呈现出遗传表观遗传遗传(DEGs)塞查规则为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个遗传表观遗传遗传会发生偏态变化无常,其中的3379个(89.4%)遗传表观遗传遗传呈现出调涨,404个(10.6%)遗传表观遗传遗传呈现出调整(图2A)。对DEGs参与聚类分析浅析法浅析,热图体现 了前10个被选中DEGs的二维分段聚类分析浅析法特色(图2B)。自后,的探索员确认GeneCards数剧信息库人工客服判定了370个将与CaOx肾结石有关于的遗传表观遗传遗传,排榜前20位的分折遗传表观遗传遗传以至于有关于性评估如图甲一样2C一样。成了看到丁酸中药治疗CaOx肾结石的核心靶点,的探索员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关于遗传表观遗传遗传治疗得出一个Venn图。终究,CYP2C9被敲定为丁酸会影响CaOx肾结石的风险靶点(图2D)。除此以外,的探索员还参与了丁酸与CYP2C9的大分子项目对接,CYP2C9的多个核苷酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸间接功用,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在根据线上药学学推测CYP2C9是丁酸影响力CaOx肾结石的靶表观遗传后,理论研究人工还进行細胞检测核实了CYP2C9可减低草酸诱导性的HK-2細胞的ROS程度、感染损坏和凋亡。

图2| 大多数据库共同讲解分析预测CYP2C9是丁酸功用于CaOx肾结石的靶表观遗传

实验最终

本调查第一个显示丁酸在身体和身上均能缓和CaOx肾结石类别的氧化物反应应激性性和慢性支原体感染受损,接着采用数据网站药剂学学筛分能够丁酸决定CaOx肾结石的隐性靶点——CYP2C9,之后采用组织实践否认CYP2C9在草酸盐诱导性的HK-2组织ROS的水平、慢性支原体感染受损和凋亡。这类显示说明丁酸将会采用缓和CYP2C9来缓和CaOx肾结石的氧化物反应应激性性,得到缓解慢性支原体感染受损。这些方式中拜谱生物技木学展示 了数据网站药剂学学的技木提供服务于,最后拜谱生物技木学可升高较为成熟完整的DNA组学、膳食纤维质组学、细胞代谢组学等两组学新产品及的技木提供服务于,诚邀拨通咨询中心! 借鉴医学文献:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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