
2024年9月由苏州农林牧大专张万刚教学创业团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生态学为该研究提供了亚硝基化淡化组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文名关键词:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
中文核心期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2026年危害分子:5.7
先生发表日子:2024年9月
大家行业:南京农业大学
研发资料:蛋白
拜谱展示 技术应用:亚硝基化修饰组学
技术水平交通路线:
一、探析最后
01.Caspase-3化学活化
日前尚不看不清楚NO对caspase-3的可抑加工用什么情况下归因于NO介导的S-亚硝基化,不同于溶度等度的GSNO对于外源性NO现货供应,以诱骗caspase-3的体内S-亚硝基化。最后认为,与没GSNO的组相对来说,100、200和400μM GSNO组的caspase-3化学活化可观降了(图1),与已经新闻稿件同步。GSNO正确处理降了caspase-3化学活化的潜在性的因为仍迫切需要具体分析。
图1 不一样的盐浓度的GSNO治理对caspase-3抗逆性的干扰
02.Caspase-3的S-亚硝基化阶段
探究Caspase-3的亚硝基化成度,以具体分析GSNO对Caspase-3的生理反应性。经GSNO正确处理后,判断到caspase-3淀粉酶S-亚硝基化抗压强度多(图2)。这数据表达,外源性GSNO塑造培养可成功的诱骗caspase-3的身体之外S-亚硝基化。惹人惊艳的是,在没了GSNO会有的比较组中判断到一微亮的S-亚硝基化带,这表达caspase-3会突发内源性的S-亚硝基化。不仅而且,本探究中caspase-3的S-亚硝基化成度较高,而caspase-3的亲水性消减,这与先前的探究同样。不过,caspase-3的特男人S-亚硝基化遮盖位点尚不很明白,还须得进一大步的研究。
图2 GSNO工作对caspase-3S-亚硝基化技术的印象
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化体现组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的回文回文序列。白色标注的回文回文序列数字代表S-亚硝基化肽,红色的标注的C数字代表S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱分析
04.S-亚硝基化Caspase-3生物降解结蛋白质
结核血清质当做另外一种注重的上皮内部骨架核血清质,在形成肌上皮内部节构特征的节构特征删改性和抽缩性方位起着注重效用,调查S-亚硝基化caspase-3对结核血清质溶解塑料的的敏各样具备着注重实际意义。与Std(未用胱天核血清质酶-3和GSNO孵育的初始状态肌仟维核血清质)组比起来,0 μM GSNO组(肌原仟维和caspase-3的孵育,无GSNO)的删改结核血清质量特殊拉低,显示系统caspase-3对结核血清质具备着自身的核血清质电离力。在GSNO孵育后,删改结核血清质的量突出提高(P < 0.05)。另外,当GSNO溶度偏高时,删改结核血清质的量持续性上浮(P < 0.05)(图5)。这一种认为认为,SNO遮盖的caspase-3以横向依懒的原则抑制作用结核血清质的溶解塑料。
图5.S-亚硝基化caspase-3可降解结蛋白酶
05.S-亚硝基化Caspase- 3化学降解肌钙球蛋白-T
肌钙血清-T (TnT)是原肌球血清调理全权负责胸肌紧缩的丝条的一定肌原化学人造纤维板血清。TnT的可溶解塑料特征英文是检验到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化环境下,caspase-3对TnT的可溶解塑料时候如下图6图示,与Std组(不包含caspase-3和GSNO的肌原化学人造纤维板)相对比,caspase-3组中30 kDa TnT情节取得加大,阐明caspase-3直接参与了TnT的可溶解塑料,除外,caspase-3与GSNO的孵育引发30 kDa TnT下滑。在100和200 μM GSNO组期间没得检验到看不出的区别(P > 0.05),而当GSNO的溶液浓度到达400 μM 时,该情节取得避免(P < 0.05)。此类察觉到阐明了SNO淡化的caspase-3对TnT可溶解塑料的阻止效用。结血清和TnT是caspase-3的特别敏感底物,而GSNO除理大大减少caspase-3的生物可能会引发肌原化学人造纤维板血清可溶解塑料成度大大减少。下面我们来分析一下下面我们来分析一下,NO诱导型的S-亚硝基化能够 进行淡化半胱氨酸残基来调理caspase-3的生物,随之进两步引响其对结血清和TnT的血清油脂水解效率,而使引响牛肉片品行。
图6. S-亚硝基化caspase- 3降解塑料肌钙蛋清-T
二、工作小结
本论述有何意义浅论S-亚硝基化对caspase-3突显的作用力试述继而对牛羊肉肌原黏胶纤维板身体外分解的作用力。血清质质S-亚硝基化是可以突显caspase-3的半胱氨酸残基,若想会造成caspase-3活力性大幅度降低,进每一步遏制了其对牛羊肉肌原黏胶纤维板血清质质的血清质质油脂水解效果。三、拜谱工作小结
探究适用了酶活测试,亚硝基化表达语组学分享,WB等查重行为,知道蛋清S-亚硝基化能够表达语caspase-3的半胱氨酸残基,这造成的了caspase-3几丁质酶的变低,相结一部阻止了其对牛羊肉肌原弹性纤维蛋清的蛋清油脂水解学习能力。本探究为表示蛋清质亚硝基化对色泽的政策调控逻辑带来了一大个新的感觉。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的血清质组学、装饰血清质组学、产生组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系列的设备,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺过酸、total腐蚀替换、解离巯基,欢迎大家咨询!
参照文献综述:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663